Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm22710-201ENSMUST00000116892 125 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Efcab7-201ENSMUST00000097959 1713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm28047Q3US59 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm5166-201ENSMUST00000121332 573 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm27295-201ENSMUST00000184264 153 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm28047Q3US59 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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