Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Q3U6N9 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
Q3U6N9 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Q3U6N9 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms