Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20163-201ENSMUST00000212232 494 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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Ccndbp1Q3TVC7 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Ccndbp1Q3TVC7 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms