Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Ctdnep1Q3TP92 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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