Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm3123-201ENSMUST00000163480 480 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Ear1-202ENSMUST00000179200 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Obox4-ps7-201ENSMUST00000196144 505 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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Ccbe1Q3MI99 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Nsun6-202ENSMUST00000076435 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Idh3a-201ENSMUST00000167866 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Ccbe1Q3MI99 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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