Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Rpusd3Q14AI6 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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