Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rrp1P56183 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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