Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpraP18052 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PtpraP18052 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm21284-201ENSMUST00000205532 3736 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PtpraP18052 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Zfp968-203ENSMUST00000131676 1272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PtpraP18052 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms