Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Vmn1r-ps12-201ENSMUST00000176946 502 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Sptan1P16546 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm8454-201ENSMUST00000196980 811 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Erc2-213ENSMUST00000211684 1074 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr678-202ENSMUST00000213622 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sptan1P16546 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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