Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
P10404 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
P10404 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
P10404 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
P10404 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
P10404 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
P10404 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
P10404 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Zfp638-203ENSMUST00000113836 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
P10404 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms