Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Ampd1-202ENSMUST00000155034 2913 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm12410-201ENSMUST00000124989 405 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Sema6a-202ENSMUST00000076043 4123 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfrbP05622 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms