Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm340F6RGI3 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms