Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Spocd1B1ASB6 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Spocd1B1ASB6 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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