Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm2229-201ENSMUST00000193328 710 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Defa-ps11-201ENSMUST00000119719 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rnf4Q9QZS2 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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