Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm11689-201ENSMUST00000120766 302 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm12630-201ENSMUST00000121575 784 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Rabgef1Q9JM13 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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