Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr461-201ENSMUST00000089490 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms