Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Cldn22Q9D7U6 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms