Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Olfr1131-201ENSMUST00000090712 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Rnase6-201ENSMUST00000095923 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm7739-201ENSMUST00000221131 1560 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccer1Q9CQL2 Gm13265-201ENSMUST00000118090 421 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms