Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm9529-201ENSMUST00000177598 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm29496-201ENSMUST00000189854 693 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Sult1c1-201ENSMUST00000024738 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm15621-201ENSMUST00000119162 364 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Nol12-205ENSMUST00000149580 646 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Fam20bQ8VCS3 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms