Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr745-202ENSMUST00000213127 1930 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26910-201ENSMUST00000180450 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nhlrc3Q8CCH2 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms