Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13702-201ENSMUST00000118542 825 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mir298-201ENSMUST00000083476 82 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk10-212ENSMUST00000170792 7203 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Lrrtm2Q8BGA3 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms