Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Klhdc9Q3USL1 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 A530017D24Rik-201ENSMUST00000101077 2315 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Klhdc9Q3USL1 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms