Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Sytl5-202ENSMUST00000086165 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44837-201ENSMUST00000206863 717 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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