Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm28156-201ENSMUST00000187880 1136 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Rpusd3Q14AI6 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rpusd3Q14AI6 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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