Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Slc25a53-214ENSMUST00000171738 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Pum1-202ENSMUST00000097862 3991 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Siah1bQ06985 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms