Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SbdsP70122 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SbdsP70122 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms