Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
RxraP28700 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms