Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
PdgfaP20033 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PdgfaP20033 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Rhox3h-201ENSMUST00000096457 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm38120-201ENSMUST00000195506 4642 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PdgfaP20033 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms