Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm12405-201ENSMUST00000141120 660 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PtprbB2RU80 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprbB2RU80 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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