Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm10603-202ENSMUST00000184420 4520 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Grik3B1AS29 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms