Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm29018-201ENSMUST00000188707 925 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm3238W4VSP7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm3238W4VSP7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms