Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5114W4VSN8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5114W4VSN8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms