Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac6Q9Z2V5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Hdac6Q9Z2V5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac6Q9Z2V5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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