Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Crlf3Q9Z2L7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Crlf3Q9Z2L7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms