Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rlbp1Q9Z275 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rlbp1Q9Z275 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms