Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ap3b1Q9Z1T1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms