Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shcbp1Q9Z179 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Shcbp1Q9Z179 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms