Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z132

Rspo1, R-spondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo1Q9Z132 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rspo1Q9Z132 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rspo1Q9Z132 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms