Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Nup160Q9Z0W3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup160Q9Z0W3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup160Q9Z0W3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms