Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slfn1Q9Z0I7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slfn1Q9Z0I7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms