Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Opn3Q9WUK7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Opn3Q9WUK7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms