Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Usp18Q9WTV6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp18Q9WTV6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms