Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma1Q9R1P4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psma1Q9R1P4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms