Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zeb2Q9R0G7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zeb2Q9R0G7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zeb2Q9R0G7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms