Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tk2Q9R088 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tk2Q9R088 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms