Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col4a3Q9QZS0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col4a3Q9QZS0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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