Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clcf1Q9QZM3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clcf1Q9QZM3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms