Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn8Q9QZ49 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ubxn8Q9QZ49 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms