Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exo1Q9QZ11 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo1Q9QZ11 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms