Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp3Q9QY23 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pkp3Q9QY23 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms